Resalut.
Bon, j'ai refait un firmware.bin à partir du dummy.bin.
Restauré une image Type C avec USB Image Tools sur deux mini-SD différentes (sait-on jamais) puis remis le firmware dessus.
Aucune évolution dans les symptomes énoncés dans mon tout premier message.
Un truc bizarre que j'ai remarqué en plus : lorsque que le molex qui va au lecteur est débranché uniquemlent côté lecteur, mais branché côté xkey, : toujours les commandes d'allumage sont inversées (eject>emulation, power > passthourgh). Si par contre j'enlève la connection du molex côité xkey (toujours avec le sata lecteur branché) et donc que je retire complètement le cable d'alim du lecteur, les commandes d'allumage sont dans le bon sens à nouveau.
Vu qu'à priori les cables sont OK, je ne vois plus d'autre solution autre qu'un problème sur le xkey lui-même. Le truc perd la boule quand un molex est branché sur le port supposé aller vers le lecteur.
MhM