Bonjour
Désoler du retard pour la réponse mais j'ai pas encore eu le temps d'ouvrir a nouveau ma 3ds depuis ^^
Pas de soucis pour ça on a tous une vie 
Qu'est ce que tu veux dire par refaire la config de base ? Laquelle ?
Formater la console en mode SYSnand , comme si tu la sortais du carton (nom , calibrage ecran etc...)
Attention:
"normalement ça devrait de garder tes saves vu que ton emunand est toujours en 9.2 est que ton profile qui est deja dans le dossier 3ds va servir a ton emunand, mais je ne suis pas sur ce point (donc si tu peux les sauvegarde fait le avant au cas ou). "
Après la c est mon avis après lecture j ai vu que toutes les personnes qui ont perdu leur save ou quel ne fonctionné pas été sur une sys 9.2 et une emu 10.X , ou parcequ il avait oublier de retire la sd lors du formatage en sysnand. Jamais lu pour une meme version .
L'installation de rxtools sans le boot par le profil DS ?
Je suis sur N3ds , et la faille profile me tente pas trop , je passe donc sur Menu hax qui me lance CtrBootManager . Donc la dessus je ne peut te guider
Cdt