Beaucoup de journalistes avaient remarqué l'absence d'e-shop sur la 3DS pendant sa présentation officielle et Nintendo a bien officialisé qu'il n'y en avait pas d'intégré avec la console vendue le jour J. Mais il y aura une mise à jour du firmware spécifique à la 3DS intégrant un web browser et un tout nouveau système de vente.
On ne parlera plus de points comme sur Wii ou les anciennes DS mais d'argent, les points que vous avez sur d'autres plateformes Nintendo seront donc automatiquement convertis dans leur vrai valeur en argent. Le système proposera plus de services que ce que propose la DS et la société nippone souhaite réellement développer l'aspect digital de sa console. Des démos, des consoles virtuelles ou encore des applications seront présents dès le lancement du nouveau firmware, qui aura lieu normalement peu de temps après la sortie de la console. Aucune information précise n'est encore donnée et il y aura des dates spécifiques pour chaque zone du monde.
